Pretty pictures of DNA liquid crystals
Posted by Frenya Wed, 05 Dec 2007 15:58:00 GMT
Liquid crystals of duplex DNA have been known since the late 1940s and played an important role in the understanding of the DNA structure. This paper published in Science studied series of self-complementary sDNA duplex-forming “palindromic” oligomers as well as noncomplementary and partially complementary oligomers of 6 to 20 base pairs. This study is original not really because of the techniques used but more because the researchers studied very small DNA sequences. So far, all studies done on liquid crystals DNA involved pieces of DNA from about 100bp to several thousands bp.
Anyhow, I noted this paper, not because I understand it… I mostly don’t! but because of the really cool pictures obtained using the Depolarized Light Microscope…
That reminded me of my second year of University in France when we studied geology and we had to be able to recognize various kinds of rocks visually by looking at them and also through the Depolarized light microscope (the coolest microscope on earth as long as you do not have to recognize 40 to 50 kinds of rocks!).
Les cristaux liquides d’ADN duplexe sont connus depuis les années 40 et ont joué un rôle important dans la résolution de la structure de l’ADN. Cet article publié dans le magazine Science étudie des séries d’ADN oligomérique simple formant des duplexes auto-complémentaires palindromiques ainsi que des oligomères non-complémentaires ou partiellement complémentaires, de 6 à 20 paires de bases. Cette étude est originale non pas à cause des techniques utilisées mais parce que les chercheurs ont étudié des séquences d’ADN très courtes. Jusqu’à maintenant, les études sur les cristaux liquides d’ADN avaient été faites sur les morceaux d’ADN de 100pb à plusieurs milliers de bases.
Mais, j’ai remarqué cet article, non pas parce que je le comprend… grosso modo, je ne le comprend pas! mais à cause des photos très “cool” obtenues avec le microscope à lumière dépolarisée… elles m’ont rappelé ma deuxième année d’université en France où j’ai étudié la géologie et nous devions être capables de reconnaitre différent types de roches visuellement en les regardant à l’oeil nu, mais aussi à travers du microscope à lumière dépolarisée… le microscope le plus intéressant de tous à partir du moment où vous n’avez pas à mémoriser 40 ou 50 roches différentes!).
Ooh, those are very pretty pictures!
Self-complementary DNA molecules “zip up” with themselves, right? So a strand that looked like this:
CATGCGCATG
...would zip up like this?
CATGC\
GTACG/
That’s right. They are also called palindromic. They can form a loop with themselves.